Análisis de la diversidad genética de tres procedencias de Costa Rica de tectona grandis L. f. (Teca), mediante el empleo de marcadores moleculares RAPD.
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Date
2020
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Publisher
Quevedo: UTEQ
Abstract
La presente investigación tuvo como objetivo evaluar la diversidad genética de tres procedencias de Tectona Grandis (teca) provenientes de plantaciones ubicadas en la República de Costa Rica, cuyo material fue plantado en la Finca Experimental “La Represa” perteneciente a la UTEQ. Para realizar la evaluación, se extrajo ADN de teca usando tres protocolos diferentes y un kit de extracción, determinando la superioridad del protocolo Uyemoto et al. (1998) en concentración (76,25 ng/µl) y del Kit de extracción de ADN PureLink Genomic DNA (Invitrogen, 2012) en pureza (75%,) se consideró también la importancia de la pureza sobre la concentración del ADN en las extracciones, razón por la que se optó por el uso del kit para extraer el ADN de los individuos a evaluar. Se evaluaron cinco individuos por cada una de las procedencias a analizadas, resultando un total de 15 individuos utilizados para la extracción de su ADN, luego se realizó la evaluación de la diversidad genética mediante PCR usando oligonucleótidos RAPD de la casa Operon, entre los que se encuentran OPA 04, OPA 10, OPA 15, entre otros. Para la evaluación de dicha diversidad, los oligonucleótidos fueron usados en combinaciones de dos, los individuos evaluados demostraron estar emparentados en función de su localización, formándose tres grupos principales correspondientes a cada procedencia, mostraron niveles bajos de polimorfismos, que tuvieron un promedio de 57,33% entre las cinco combinaciones.
Palabras claves: Diversidad, evaluación, extracción de ADN, marcadores moleculares
Description
This research aimed to assess the genetic diversity of three Tectona Grandis origins (teca) from plantations located in the Republic of Costa Rica, whose material was planted in the Experimental Finca "La Represa" belonging to the UTEQ. To perform the evaluation, tee DNA was extracted using three different protocols and an extraction kit, determining the superiority of the Uyemoto et al protocol. (1998) in concentration (76.25 ng/l) and the PureLink Genomic DNA DNA Extraction Kit (Invitrogen, 2012) in purity (75.00%), the importance of purity on DNA concentration in extractions was also considered, which was why the use of the kit to extract DNA from the individuals to be evaluated was also considered. Five individuals were evaluated for each of the sources to be analyzed, resulting in a total of 15 individuals used for the extraction of their DNA, then the evaluation of genetic diversity by PCR was performed using RAPD oligonucleotides of the Operon house, among which are OPA 04, OPA 10, OPA 15, among others. For the assessment of this diversity, oligonucleotides were used in combinations of two, the individuals evaluated proved to be related according to their location, forming three main groups corresponding to each source, showed low levels of polymorphs, which averaged 57.33% among the five combinations.
Keywords: Diversity, evaluation, DNA extraction, molecular markers.
Keywords
Diversidad, Evaluación, Extracción de ADN, Marcadores moleculares
Citation
Quintana Risco, Rodolfo Fernando. (2020).Análisis de la diversidad genética de tres procedencias de Costa Rica de tectona grandis L. f. (Teca), mediante el empleo de marcadores moleculares RAPD. Quevedo. UTEQ 72 p.