"Interfaz web al software de alineamiento múltiple de secuencias con metaheuristica multiobjetivo (M2ALIGN)"
| dc.contributor.advisor | Zambrano Vega, Cristian | |
| dc.contributor.author | Soria Brito, Jefferson Edilberto | |
| dc.date.accessioned | 2020-09-07T20:19:48Z | |
| dc.date.available | 2020-09-07T20:19:48Z | |
| dc.date.issued | 2017 | |
| dc.description | The main objective of this research is provide the scientific community with a web interface for quick and easy use to the multi-objective optimizer software for the Multiple Sequence Alignment (M2Align) called W-M2Align. Among the main functionalities of this web platform are the following input parameters: Sequences File: Set of unaligned biological sequences in FASTA format. Number of Evaluations: The maximum number of algorithm evaluations. Population Size: Size of the population of the algorithm Email: To receive the link with the execution results (Multiple Sequence Alignments and an approximation of the Pareto Front). Pre-computed Alignments: MSA’s performed by others heuristic tools to generate the initial solutions of the algorithm. All calculations are performed by a dedicated web-server with more than 60 cores for computational processing and the users receive the results via URL or email. It allows to perform a monitoring of the processes through its states (Running, Finished or Error), as well as the possibility of downloading the files of the execution. W-M2Align is available at http://bioinformatic.uteq.edu.ec/m2align/. It is free and open to all users and there is no login requirement. Keywords: Web Interface, Multiple Sequence Alignment, MultiObjective Optimization | es_ES |
| dc.description.abstract | El objetivo principal del presente trabajo de investigación es brindar a la comunidad científica una interfaz web de fácil y rápido uso al software optimizador multiobjetivo M2Align para el Alineamiento Múltiple de Secuencias denominado W-M2Align. Entre las principales funcionalidades de la plataforma web están los siguientes parámetros de entrada: Archivo de secuencias: Conjunto de secuencias biológicas sin alinear en formato FASTA. Numero de evaluaciones: El número máximo de evaluaciones del algoritmo. Tamaño población: Tamaño de la población del algoritmo. Email: Para recibir el vínculo con los resultados de la ejecución (Alineamiento múltiple de secuencias y una aproximación al Frente de Pareto). Alineamientos pre-computarizados: MSA's realizadas por otras herramientas heurísticas para generar las soluciones iniciales del algoritmo. Todos los cálculos se realizan en un servidor dedicado con más de 60 núcleos para procesamiento computacional y los usuarios reciben los resultados a través de URL o correo electrónico. Permite realizar un monitoreo de los procesos a través de sus estados (Ejecutándose, Finalizado o Error), así como la posibilidad de descargar los archivos productos de la ejecución. W-M2Align está disponible en http://bioinformatic.uteq.edu.ec/m2align/. Es gratuito y abierto a todos los usuarios y no requiere de inicio de sesión. Palabras clave: Interfaz Web, Alineamiento Múltiple de Secuencias. Optimización MultiObjetivo. | es_ES |
| dc.format.extent | 104p. | es_ES |
| dc.identifier.citation | Soria Brito, Jefferson Edilberto. (2017). "Interfaz web al software de alineamiento múltiple de secuencias con metaheuristica multiobjetivo (M2ALIGN)". Quevedo. UTEQ 104 p. | es_ES |
| dc.identifier.other | 1300112 | |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.uteq.edu.ec/handle/43000/4061 | |
| dc.language.iso | spa | es_ES |
| dc.publisher | Quevedo: UTEQ | es_ES |
| dc.rights | openAccess | es_ES |
| dc.subject | Interfaz web | es_ES |
| dc.subject | Alineamiento múltiple de secuencias | es_ES |
| dc.subject | Optimización, Multiobjetivo | es_ES |
| dc.title | "Interfaz web al software de alineamiento múltiple de secuencias con metaheuristica multiobjetivo (M2ALIGN)" | es_ES |
| dc.type | bachelorThesis | es_ES |
