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http://repositorio.uteq.edu.ec/handle/43000/4061| Título : | "Interfaz web al software de alineamiento multiple de secuencias con metaheuristica multiobjetivo (M2ALIGN)" |
| Autor : | Zambrano Vega, Cristian Soria Brito, Jefferson Edilberto |
| Palabras clave : | Interfaz web Alineamiento múltiple de secuencias Optimización, Multiobjetivo |
| Fecha de publicación : | 2017 |
| Editorial : | Quevedo: UTEQ |
| Citación : | Soria Brito, Jefferson Edilberto (2017). "Interfaz web al software de alineamiento multiple de secuencias con metaheuristica multiobjetivo (M2ALIGN)". Quevedo. UTEQ 104p. |
| Resumen : | El objetivo principal del presente trabajo de investigación es brindar a la comunidad científica una interfaz web de fácil y rápido uso al software optimizador multiobjetivo M2Align para el Alineamiento Múltiple de Secuencias denominado W-M2Align. Entre las principales funcionalidades de la plataforma web están los siguientes parámetros de entrada: Archivo de secuencias: Conjunto de secuencias biológicas sin alinear en formato FASTA. Numero de evaluaciones: El número máximo de evaluaciones del algoritmo. Tamaño población: Tamaño de la población del algoritmo. Email: Para recibir el vínculo con los resultados de la ejecución (Alineamiento múltiple de secuencias y una aproximación al Frente de Pareto). Alineamientos pre-computarizados: MSA's realizadas por otras herramientas heurísticas para generar las soluciones iniciales del algoritmo. Todos los cálculos se realizan en un servidor dedicado con más de 60 núcleos para procesamiento computacional y los usuarios reciben los resultados a través de URL o correo electrónico. Permite realizar un monitoreo de los procesos a través de sus estados (Ejecutándose, Finalizado o Error), así como la posibilidad de descargar los archivos productos de la ejecución. W-M2Align está disponible en http://bioinformatic.uteq.edu.ec/m2align/. Es gratuito y abierto a todos los usuarios y no requiere de inicio de sesión. Palabras clave: Interfaz Web, Alineamiento Múltiple de Secuencias. Optimización MultiObjetivo. |
| Descripción : | The main objective of this research is provide the scientific community with a web interface for quick and easy use to the multi-objective optimizer software for the Multiple Sequence Alignment (M2Align) called W-M2Align. Among the main functionalities of this web platform are the following input parameters: Sequences File: Set of unaligned biological sequences in FASTA format. Number of Evaluations: The maximum number of algorithm evaluations. Population Size: Size of the population of the algorithm Email: To receive the link with the execution results (Multiple Sequence Alignments and an approximation of the Pareto Front). Pre-computed Alignments: MSA’s performed by others heuristic tools to generate the initial solutions of the algorithm. All calculations are performed by a dedicated web-server with more than 60 cores for computational processing and the users receive the results via URL or email. It allows to perform a monitoring of the processes through its states (Running, Finished or Error), as well as the possibility of downloading the files of the execution. W-M2Align is available at http://bioinformatic.uteq.edu.ec/m2align/. It is free and open to all users and there is no login requirement. Keywords: Web Interface, Multiple Sequence Alignment, MultiObjective Optimization |
| URI : | http://repositorio.uteq.edu.ec/handle/43000/4061 |
| Aparece en las colecciones: | Tesis de Pregrado - Ingeniería en Sistemas |
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| Fichero | Descripción | Tamaño | Formato | |
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