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Título : "Interfaz web al software de alineamiento multiple de secuencias con metaheuristica multiobjetivo (M2ALIGN)"
Autor : Zambrano Vega, Cristian
Soria Brito, Jefferson Edilberto
Palabras clave : Interfaz web
Alineamiento múltiple de secuencias
Optimización, Multiobjetivo
Fecha de publicación : 2017
Editorial : Quevedo: UTEQ
Citación : Soria Brito, Jefferson Edilberto (2017). "Interfaz web al software de alineamiento multiple de secuencias con metaheuristica multiobjetivo (M2ALIGN)". Quevedo. UTEQ 104p.
Resumen : El objetivo principal del presente trabajo de investigación es brindar a la comunidad científica una interfaz web de fácil y rápido uso al software optimizador multiobjetivo M2Align para el Alineamiento Múltiple de Secuencias denominado W-M2Align. Entre las principales funcionalidades de la plataforma web están los siguientes parámetros de entrada: Archivo de secuencias: Conjunto de secuencias biológicas sin alinear en formato FASTA. Numero de evaluaciones: El número máximo de evaluaciones del algoritmo. Tamaño población: Tamaño de la población del algoritmo. Email: Para recibir el vínculo con los resultados de la ejecución (Alineamiento múltiple de secuencias y una aproximación al Frente de Pareto). Alineamientos pre-computarizados: MSA's realizadas por otras herramientas heurísticas para generar las soluciones iniciales del algoritmo. Todos los cálculos se realizan en un servidor dedicado con más de 60 núcleos para procesamiento computacional y los usuarios reciben los resultados a través de URL o correo electrónico. Permite realizar un monitoreo de los procesos a través de sus estados (Ejecutándose, Finalizado o Error), así como la posibilidad de descargar los archivos productos de la ejecución. W-M2Align está disponible en http://bioinformatic.uteq.edu.ec/m2align/. Es gratuito y abierto a todos los usuarios y no requiere de inicio de sesión. Palabras clave: Interfaz Web, Alineamiento Múltiple de Secuencias. Optimización MultiObjetivo.
Descripción : The main objective of this research is provide the scientific community with a web interface for quick and easy use to the multi-objective optimizer software for the Multiple Sequence Alignment (M2Align) called W-M2Align. Among the main functionalities of this web platform are the following input parameters: Sequences File: Set of unaligned biological sequences in FASTA format. Number of Evaluations: The maximum number of algorithm evaluations. Population Size: Size of the population of the algorithm Email: To receive the link with the execution results (Multiple Sequence Alignments and an approximation of the Pareto Front). Pre-computed Alignments: MSA’s performed by others heuristic tools to generate the initial solutions of the algorithm. All calculations are performed by a dedicated web-server with more than 60 cores for computational processing and the users receive the results via URL or email. It allows to perform a monitoring of the processes through its states (Running, Finished or Error), as well as the possibility of downloading the files of the execution. W-M2Align is available at http://bioinformatic.uteq.edu.ec/m2align/. It is free and open to all users and there is no login requirement. Keywords: Web Interface, Multiple Sequence Alignment, MultiObjective Optimization
URI : http://repositorio.uteq.edu.ec/handle/43000/4061
Aparece en las colecciones: Tesis de Pregrado - Ingeniería en Sistemas

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